Os serviços de saúde para a população de Jijoca são oferecidos em 6 unidades básicas de saúde e por 7 equipes de Saúde da Família, compostas por médico, enfermeiro, auxiliar de enfermagem, cirurgião-dentista e atendente de consultório dentário, e agentes comunitários de saúde, sendo que o Centro de Saúde da Família (posto da sede) comporta duas equipes de saúde.
Nas localidades de abrangência do município foram montados 10 unidades de apoio para que os atendimentos mais simples ficassem mais próximos a população, garantindo assim acessibilidade ao serviço sem diminuir sua qualidade. A frota de veículos da atenção básica, recentemente adquiridos, somam 4 gols e 3 alugados para as equipes. Já para o atendimento de urgência/emergência a sede do município conta com 3 ambulâncias e uma em Jericoacoara, sendo tracionada.